Этот диплодоцид имел очень интересную особенность: ряд шипов до 65см в длину каждый, располагавшихся на спине и шеи. Они могли образовывать шипастую гриву или быть покрытыми кожей, создавая структуру наподобие двойного паруса. Какую бы они не принимали форму, это было очень необычное приспособление, и, вероятно, оно играло роль социальной жизни животного или использовалось для защиты – ценное приобретение для животного, которое было, чуть ли не вдвое короче своих родственников.
Амаргазавр имел тонкий хлыстоподобный хвост и тупые зубы, приспособленные для обрывания листвы с веток. Как и другие зауроподы, он, вероятно, глотал камни, или гастролиты, чтобы помогать перевариванию пищи. Своим шипастым позвоночником амаргазавр напоминал дикреозавра, и некоторые палеонтологи выделяют эти два вида в особое семейство. Средней по величине Амаргазавр относился к динозаврам –– зауроподам.
Передвигался на четырех конечностях и имел маленькую голову. Зубами, напоминавшими колышки.. он объедал хвойные растения и папоротники. Грубая растительная пища перетиралась в желудке благодаря гастролитам. Вдоль его спины, которые обтягивала кожа, образуя двойной парус. Эти костяные отростки могли достигать 50 см, и с ними Амаргазавр казался более крупным. Имелся у них и недостаток: они ограничивали движения шеи и не обладали достаточной прочностью.